В 2009 году немка получила двухлетнее отстранение за нарушение антидопинговых правил. Спортсменка категорически отрицала применение запрещённых веществ и обратилась с апелляцией в Спортивный арбитражный суд (CAS), однако он поддержал первоначальное решение о её дисквалификации.
В январе 2015 года Высший региональный суд Мюнхена рассмотрел иск Пехштайн против ISU. Из-за дисквалификации немка была вынуждена пропустить Олимпийские игры 2010 года в Ванкувере. До этого она становилась золотым призёром четырёх Олимпиад подряд (1994, 1998, 2002 и 2006).
4 марта нынешнего года ISU объявил, что спор между сторонами урегулирован.
В активе Пехштайн также имеются две серебряные и две бронзовые награды Олимпийских игр.





