Попов является воспитанником СДЮШОР города Перми. За карьеру выступал за такие клубы как «Звезда», «Рубин» и «Амкар». Всего провел 489 матчей и забил 10 голов.
Защитник и ветеран «Амкара» Алексей Попов принял решение о завершении футбольной карьеры, сообщает официальный твиттер команды.