В минувшем сезоне Коутиньо выступал за «Баварию» на правах аренды, за что мюнхенский клуб заплатил каталонцам 8,5 миллионов евро. У баварцев было право приобрести бразильского футболиста, но чемпионы Германии и победители Лиги чемпионов приняли решение воздержаться от дорогостоящей покупки.

Всего Филиппе сыграл за «Баварию» 38 матчей, забив 11 мячей и сделав девять голевых передач. В четвертьфинале Лиги чемпионов, в котором мюнхенцы разгромили «Барселону» 8:2, Коутиньо сделал дубль, а также помог отличиться Роберту Левандовски.

В январе 2018 года сине-гранатовые приобрели бразильца у «Ливерпуля» за 145 миллионов евро.