В чемпионате России уругвайский форвард принял участие в 14 матчах, в которых забил три мяча и отдал одну результативную передачу. В Лиге чемпионов 28-летний нападающий провел на поле всего семь минут в домашнем матче с «Реалом» (3:0).

В ЦСКА Эрнандес перешел 1 августа 2018 года на правах свободного агента.